Uit noodzaak werd rond 13.00 uur het treinverkeer van en naar Amsterdam stilgelegd. Het treinverkeer werd om 17.00 uur mondjesmaat hervat, maar werd soms ook weer stilgelegd. Op het plein voor het Centraal Station wachtten duizenden mensen 's avonds laat voor vertrek. Ze konden het station niet in, omdat dat noodgedwongen was afgesloten. In het station en op de perrons hadden zich te veel mensen verzameld.

De sfeer werd in de loop van de avond zo grimmig dat mensen met flessen en andere voorwerpen begonnen te gooien. Daarop greep de Mobiele Eenheid in en veegde het plein voor het Centraal Station schoon. Er werden 25 arrestaties verricht en er vielen enkele gewonden onder zowel het publiek als de politie. In totaal waren er 250 ME'ers op de been.

Volgens een woordvoerder van de NS hebben feestvierders eerder op de dag de chaos veroorzaakt. Zij vonden het te lang duren voordat ze in Amsterdam aankwamen. Door aan de noodrem te trekken en over het spoor te gaan lopen, legden ze in feite het hele treinverkeer van en naar Amsterdam plat. De NS ontkent dat ze geen rekening had gehouden met de grote toeloop van koninginnedagvierders naar Amsterdam.

,,Dit heb ik nog nooit meegemaakt'', omschreef een medewerker van de Spoorwegpolitie de chaotische situatie. Het publiek was woedend en reageerde dat onder meer af op het straatmeubilair en door winkelruiten in te gooien. De schade was aanzienlijk.

Na 01.00 uur werd het treinverkeer deels hervat en werden groepen van enkele honderden reizigers door het cordon van ME'ers toegelaten om de trein te nemen. De NS garandeerde niet dat ze iedereen die via het spoor naar huis wilde ook daadwerkelijk kon vervoeren. Omdat het treinverkeer van en naar Amsterdam niet mogelijk was, hadden reizigers op andere stations ook last van vertragingen.

Volgens een woordvoerder van de Railverkeersleiding zijn in totaal duizenden reizigers gedupeerd. In sommige steden liepen de vertragingen op tot ruim een uur. Ook vielen er treinen uit.

Amsterdam telde tijdens de Koninginnedag 700.000 bezoekers, iets meer dan vorig jaar, maar kende afgezien van de chaos op en rond het spoor weinig incidenten. Ook elders verliep de Koninginnedag rustig. In Utrecht arresteerde de politie 24 mensen, voornamelijk voor openbare dronkenschap, geweldpleging en wildplassen. Volgens de politie was het in de Domstad drukker dan voorgaande jaren.

Net als in Amsterdam liep het ook in Genemuiden uit de hand. Ongeveer 1500 jongeren bekogelden de politie met bakstenen en bierflesjes omdat de traditionele brommerraces waren verboden. De politie arresteerde 47 mensen. In Noordoost-Friesland werd Koninginnedag niet gevierd. Door de MKZ-gevallen in Ee en Anjum waren alle activiteiten afgelast. Daardoor was de vrijmarkt in Leeuwarden met 40.000 bezoekers drukker dan verwacht.

Op de vrijmarkten in Nederland liet Máxima zich in vele gedaantes zien. Maar de verloofde van prins Willem-Alexander verraste de Nederlanders niet op een onverwacht bezoek. Wel verscheen ze met de kroonprins op paleis Soestdijk, waar ook andere leden van de koninklijke familie prinses Juliana bezochten, die maandag 92 jaar werd.

Overigens kende Meppel en Hoogeveen ook zonder Máxima en Beatrix een hoogtijdag. Volgens de woordvoerders van de gemeentebesturen in beide plaatsen overtrof het aantal bezoekers alle verwachtingen. In Meppel waren het er 50.000, Hoogeveen telde 30.000 bezoekers. De koningin had haar bezoek aan de Drentse plaatsen afgezegd om verspreiding van het mond- en klauwzeervirus te voorkomen.

Zondag bezocht Beatrix wel onaangekondigd een kerkdienst in het getroffen dorp Oene. Ook premier Kok ging in zijn felicitatie aan prinses Juliana en mr. Pieter van Vollenhoven niet voorbij aan de mond- en klauwzeerepidemie. Hij betuigde in zijn toespraak medeleven aan de boerengezinnen die zijn getroffen door de MKZ-crisis.